По данным следственного комитета, против Лысенко было возбуждено уголовное дело по ч. 6 ст. 290 УК РФ (получение взятки в особо крупном размере). Также уголовное дело по факту посредничества во взяточничестве было возбуждено в отношении одного из его подчиненных.
По версии следствия в 2024 году один из застройщиков дал Лысенко взятку в виде земельного участка и оказания услуг в виде строительства на нём жилого дома на общую сумму более 8 миллионов рублей.
Взятка предназначалась за организацию строительства школы за счёт бюджетных средств на застраиваемой предпринимателем территории и включение объекта в программу комплексного развития территорий Ростовской области.
Следователи сообщают, что в настоящее время по уголовному делу выполняются следственные действия, направленные на установление всех обстоятельств преступления.